ボストン大学フレデリック・S・パーディー国際学部（The Frederick S. Pardee School of Global Studies）の大学院プログラムについては6つのMA（修士）プログラムを提供しており、8つの機能的専門分野、2つの二重学位プログラム、1つの地域学位、そして4つの大学院証明書プログラムがあります。学生は、学際的な境界を越えて、グローバルアフェアーズに関する包括的な理解を構築するための幅広いカリキュラムを学びます。
大学院プログラムには、以下のものが含まれます：
- MA in International Affairs (国際関係)
- MA in Global Policy (グローバルポリシー)
- One-Year MA in International Relations (国際関係の1年制MAプログラム)
- Latin American Studies (ラテンアメリカ研究)
- International Relations & Juris Doctor (国際関係と法学博士)
- International Relations & Master of Business Administration (国際関係と経営学修士)
さらに、アフリカ研究、アジア研究、ラテンアメリカ研究、ムスリム研究の4つの大学院証明書プログラムも提供されています。